Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA)
UMR INRA 1061

De par son contexte régional, UGMA (Unité de Génétique Moléculaire Animale) – Unité mixte de recherche Université/INRA s’intéresse particulièrement à la production bovine allaitante par l’étude du génome bovin et son fonctionnement afin de mieux comprendre comment la variabilité génétique contrôle la variabilité phénotypique de certains caractères d’intérêt agronomique, donc d’intérêt pour la filière.

Les deux principales thématiques sont : 1) l’identification de régions, gènes et/ou mutations causales impliqués dans le développement musculaire, le développement squelettique et les qualités de la viande, ainsi que l’étude fonctionnelle des réseaux de gènes impliqués dans ces caractères 2) l’étude des gènes impliqués dans les modifications post-traductionnelles des protéines (glycosylation), avec leurs effets dans des fonctions diverses, en particulier le développement musculaire. Nos projets reposent sur des approches de biologie intégrative, plus particulièrement de génomique fonctionnelle, de bioinformatique.

Nous exploitons des modèles cellulaires et animaux pour répondre aux questions fondamentales posées.

Génomique bovine Glycobiologie et myogenèse Aspects génétiques et épigénétiques de la qualité de la viande

Génomique fonctionnelle – Muscle – Différenciation cellulaire – Marqueurs génétiques –  bioinformatique – Modèles souris – Diversité génétique

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Outils d’analyse de l’ADN des ARN et des protéines Outils d’analyses cellulaires

Caractérisation, essai, tests Conseil, expertise, formation Recherche et développement

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– Allais S., Journaux L., Levéziel H., Payet-Duprat N., Raynaud P., Hocquette J.F., Lepetit J., Rousset S., Denoyelle C., Bernard-Capel C., Renand G. (2011). « Effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes on meat tenderness in 3 French beef breeds ». Journal of Animal Science. 89:1-11 – Blanchet X., Péré-Brissaud A., Duprat N., Pinault E., Delourme D., Ouali A., Combet C., Maftah A., Pélissier P., Brémaud L. (2012). « Mutagenesis of the bovSERPINA3-3 demonstrates the requirement of aspartate-371 for inter-molecular interaction and formation of dimers ». Protein Science. 21 (7): 277-286 – Laporte B., Petit D.P., Rocha D., Boussaha M., Grohs C., Maftah A., Petit J-M. (2012). « Characterization of bovine FUT7 furthers understanding of FUT7 evolution in mammals ». BMC Genetics. 13: 74 – Monestier O., Brun C., Heu K., Passet B., Malhouroux M., Magnol L., Vilotte JL., Blanquet V. (2012). « Ubiquitous Gasp1 overexpression in mice leads mainly to a hypermuscular phenotype ». BMC Genomics. 13(1): 541 – Monestier O., Brun C., Coquempot C., Petit D., Blanquet V. (2012). « GASP/WFIKKN proteins: evolutionary aspects of their functions ». PLoS ONE. 7(8): e43710 – Ciampolini R., Cecchi F., Spaterna A., Bramante A., Bardet S.M., Oulmouden A. (2012). « Characterization of different 5′-untranslated exons of the ASIP gene in black-and-tan Doberman Pinscher and brindle Boxer dogs ». Animal genetics. 44: 114-117. – Dunner S., Sevane N., Garcia D., Cortés O., Valentini A., Williams J.L., Mangin B., Canon J., Levéziel H. and the GeMQual Consortium 2013a. « Association of genes involved in carcass and meat quality traits in 15 European bovine breeds. Livestock Science », 154, 34-44. – Grassot V, Da Silva A, Saliba J, Maftah A, Dupuy F, Petit JM. « Highlights of glycosylation and adhesion related genes involved in myogenesis ». BMC Genomics. 2014 Jul 22;15:621. – Meersseman C., Léjard V., Rrbours E., Boussaha M., Maftah A., Petit D., Rocha D. (2014). « Bovine Twinkle and Mitochondrial Ribosomal Protein L43 genes are regulated by an evolutionary conserved bidirectional promoter ». Gene. 537: 154-163 – Bouyer C, Forestier L, Renand G, Oulmouden A. « Deep intronic mutation and pseudo exon activation as a novel muscular hypertrophy modifier in cattle ». PLoS One. 2014 May 14;9(5):e97399.

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Collaborations universitaires nationales actives : Université de Lille ; Université Blaise Pascal Clermont Fd ; Université d’Auvergne Clermont Fd ; Institut Pasteur Paris ;  INSERM U602 ; Université de Paris Sud XI ; Montpellier Collaborations universitaires internationales en cours : Université de Pise (Italie) ; Université de Bologne (Italie) ; Université Libanaise (Liban) ; Université de Debrecen (Hongrie) ; Université of Pecs (Hongrie) ; Université de Blida (Algérie) ; Université de Jordanie ; Institut Agronomique et Vétérinaire Hassan II de Rabat (Maroc) Coopérations industrielles  : Institut de l’élevage ; Allice ; Ingenomix ; Pôle de Lanaud ; Melipharm Partenariats avec des organismes et institutions nationaux : CNRS, INSERM Partenariats avec des organismes et institutions internationaux : German research Center for Environmental Health, Munich Groupements d’intérêt scientifique (GIS) : GIS MVPC « Muscle Viandes et Produits Carnés » ; AGENAE Groupements de recherche (GDR) :  GEIST (FR3503)