Un nouveau papier auquel Thibault Stalder – membre de l’UMR Inserm 1092 RESINFIT – a participé, est accessible en ligne. Il s’intitule « Detection of rare plasmid hosts using a targeted Hi-C approach ».

Extrait de l’abstract (traduit de l’anglais) : « Malgré le rôle important que jouent les plasmides dans l’évolution microbienne, les connaissances sur leur écologie, leur évolution et leur transfert dans les communautés microbiennes sont limitées. Ceci est en partie dû aux limites des méthodes actuelles pour associer un plasmide à son hôte dans les microbiomes. Pour combler cette lacune, nous avons développé et mis en œuvre une nouvelle approche pour identifier les hôtes rares des plasmides en combinant Hi-C, une méthode de ligature de proximité, avec l’enrichissement pour l’ADN spécifique des plasmides. Nous appelons cette approche Hi-C+. […] »

Cette publication est disponible dans le journal ISME Communications – Journal officiel de la Société internationale d’écologie microbienne – qui traite des domaines divers et intégrés de l’écologie microbienne, couvrant ainsi l’ensemble de la vie microbienne.

• Accéder à la publication « Detection of rare plasmid hosts using a targeted Hi-C approach«