Détails
Présentation
Souleiman El Balkhi a créé albuminomics.org, une base de connaissances ouverte consacrée aux modifications post-traductionnelles de l’albumine sérique humaine et à ce qu’elles peuvent révéler sur le fonctionnement du foie.
Depuis plusieurs années, notre travail à l’INSERM UMR1248 / CHU de Limoges consiste à « lire » l’histoire inscrite sur une seule protéine : l’albumine. Ses différentes modifications — oxydation, glycation, cystéinylation, troncation, etc. — enregistrent plusieurs semaines de stress métabolique et oxydatif et peuvent être exploitées comme biomarqueurs de lésions hépatiques et de stadification des maladies du foie.
Du cuivre échangeable (désormais recommandé dans les recommandations de l’EASL sur la maladie de Wilson) au test fonctionnel SEB, en passant par le profilage top-down des isoformes, ces travaux constituent un long parcours scientifique qui, jusqu’à présent, était dispersé entre publications et brevets.
Souleiman a donc rassemblé ces connaissances dans un espace ouvert, interconnecté et librement réutilisable (CC BY). Il y a également ajouté une couche lisible par machine, afin que les modèles d’IA puissent eux aussi retrouver, exploiter et citer ces travaux — et pas seulement les chercheurs.